Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MyripQ8K3I4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MyripQ8K3I4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms