Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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