Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cldn34c1Q8K193 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cldn34c1Q8K193 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cldn34c1Q8K193 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cldn34c1Q8K193 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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