Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot3Q8K0V4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot3Q8K0V4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms