Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc4a8Q8JZR6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a8Q8JZR6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms