Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Znf628Q8CJ78 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf628Q8CJ78 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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