Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Card11Q8CIS0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Card11Q8CIS0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms