Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Csnka2ipQ8CH19 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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