Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

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Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Setd1bQ8CFT2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms