Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pramef8Q8CE24 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramef8Q8CE24 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms