Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc17Q8CE13 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms