Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip1Q8CBD1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms