Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atxn7l2Q8C8K6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn7l2Q8C8K6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn7l2Q8C8K6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn7l2Q8C8K6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn7l2Q8C8K6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn7l2Q8C8K6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn7l2Q8C8K6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn7l2Q8C8K6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms