Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe22Q8C6A8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms