Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8C3W1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C3W1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8C3W1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms