Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc44a2Q8BY89 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc44a2Q8BY89 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc44a2Q8BY89 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc44a2Q8BY89 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc44a2Q8BY89 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc44a2Q8BY89 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc44a2Q8BY89 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms