Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms