Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnpy4Q8BQ47 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms