Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms