Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atg4dQ8BGV9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4dQ8BGV9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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