Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smndc1Q8BGT7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms