Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdspl2Q8BG15 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms