Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpped1Q8BFS6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms