Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem39bQ810L4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms