Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc28Q80XJ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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