Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms