Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NischQ80TM9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
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