Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clec18aQ7TSQ1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec18aQ7TSQ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms