Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek5Q7TSC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek5Q7TSC3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek5Q7TSC3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms