Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ubfd1Q78JW9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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