Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms