Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspg5Q71M36 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms