Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms