Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm3bQ6ZPY7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms