Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms