Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc44a1Q6X893 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms