Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms