Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtifQ6PEE2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtifQ6PEE2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms