Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms