Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Zbtb40Q6PCS8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbtb40Q6PCS8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbtb40Q6PCS8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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