Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp49Q6P9L4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp49Q6P9L4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms