Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Podnl1Q6P3Y9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Podnl1Q6P3Y9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms