Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx4Q6P1D7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx4Q6P1D7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms