Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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Soga3Q6NZL0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Soga3Q6NZL0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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