Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frem2Q6NVD0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frem2Q6NVD0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms