Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SphkapQ6NSW3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SphkapQ6NSW3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms