Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdcd11Q6NS46 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms