Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw2Q6I6G8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw2Q6I6G8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms