Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScapQ6GQT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms