Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop58Q6DFW4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms